Sirup jagung fruktosa tinggi dan gula rafinasi berbeda secara signifikan dalam komposisi, kegunaan, dan khasiat kesehatan. Sirup jagung fruktosa tinggi (mengandung 40-55% glukosa dan 42-55% fruktosa) dibuat dari bahan tanaman yang dihidrolisis. Ia memiliki kelarutan yang tinggi (Lebih besar dari atau sama dengan 78% pada 20 derajat) dan sifat melembabkan (aktivitas air 0,6-0,7), sehingga cocok untuk minuman (meningkatkan rasa manis sebesar 20-30%) dan pembuatan kue (memperpanjang umur simpan 2-3 hari). Kandungan kalorinya 260kkal/100g, 32,8% lebih rendah dibandingkan gula rafinasi (387kkal/100g), sehingga lebih cocok untuk pengembangan pangan kesehatan. Gula rafinasi (kemurnian sukrosa Lebih besar dari atau sama dengan 99,7%) memiliki kristalinitas tinggi dan mendorong reaksi Maillard selama pemanggangan (suhu pencoklatan 150-180 derajat), tetapi memiliki higroskopisitas yang lemah (aktivitas air 0,3-0,4).
